На данный момент все доступное программное обеспечение выпущенное для Nintendo DS может воспроизводиться на Nintendo Dsi. Однако, Nintendo DSi не имеет разъем Game Boy Advance Game Pak Slot, поэтому некоторые игры Nintendo DS, которые используют разъем GBA Game Pak Slot не могут быть воспроизведены полностью или частично.

Это касается игр, в которых допускается обмен данными между Nintendo DS Game Card и Game Boy Advance Game Pak, или игр, в которых требуется использование аксессуара в отверстии GBA Game Pak Slot.

Ниже приведен список продуктов Nintendo DS которые полностью или частично несовместимы с Nintendo DSi:

•Guitar Hero On Tour и Guitar Hero Decades – полностью несовместимы.

•Pokémon Diamond, Pokémon Pearl, Pokémon Platinum, Pokémon Dash и Pokémon Mystery Dungeon: Blue Rescue Team – недоступны только некоторые компоненты.

•Эти аксессуары несовместимы с Nintendo DSi - Nintendo DS Rumble Pak, Nintendo MP3 Player, Nintendo DS Browser, Nintendo DS Lite Browser, Nintendo DS Memory Expansion Pak, Nintendo DS Lite Memory Expansion Pak, Guitar Hero “Guitar Grip”.

В будущем, в играх DS, возможно, появятся новые особенности, которыми можно будет насладиться только на Nintendo DSi, или которые вообще не будут воспроизводиться на системах Nintendo DS или Nintendo DS Lite. Информация об этом будет размещена на упаковке продукта и на веб странице игры.